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> 細(xì)胞系的錯誤鑒定該如何解決
細(xì)胞系的錯誤鑒定該如何解決
發(fā)布日期:2019-03-12 瀏覽次數(shù):1303
細(xì)胞系對于生物醫(yī)學(xué)研究是非常有價值的工具。然而,它們作為正?;蚧疾〗M織模型的有效性有賴于它們真的是研究人員所認(rèn)為的組織類型和物種。不幸的是,據(jù)估計常用的細(xì)胞系中有14%~16%是被錯誤鑒別的。
錯誤鑒別通常源于交叉污染(一種培養(yǎng)物被在同一實驗室中培養(yǎng)的另一種細(xì)胞系接替),也可能源于細(xì)胞培養(yǎng)中的錯誤操作。*,迄今為止建立的個人類癌細(xì)胞系HeLa細(xì)胞具有頑強的生命力,它們甚至可以存活在氣溶膠液滴中并以此方式污染其它細(xì)胞。由于HeLa細(xì)胞生長得特別快,它們終會在數(shù)量上超過其它細(xì)胞。研究發(fā)現(xiàn)被錯誤鑒別的細(xì)胞系中有30%~50%是HeLa衍生物[2,3]。對于大多數(shù)錯誤鑒別的細(xì)胞系來說,再也找不到真實的儲備了。
盡管從20世紀(jì)60年代以來人們已經(jīng)意識到了細(xì)胞系錯誤鑒別的問題,但這個問題仍然普遍存在。例如,在1968年HEp-2被證明是HeLa(宮頸癌細(xì)胞)衍生物,但每年仍有研究人員將其作為喉癌細(xì)胞系研究并發(fā)表論文[1]。在很長一段時間里,期刊和資助機構(gòu)都沒有適當(dāng)?shù)恼咭罂茖W(xué)家們對他們使用的細(xì)胞系進(jìn)行鑒定。在過去的十年中情況有所轉(zhuǎn)變,現(xiàn)在越來越多期刊要求或鼓勵作者進(jìn)行細(xì)胞系的鑒定[1,4],包括BioMedCentral的期刊、《International Journalof Cancer》、Nature出版集團的期刊等等。由于這類期刊數(shù)量不斷增加且不同期刊之間要求各異,因此在提交論文前檢查特定期刊的指南非常重要。例如,除了細(xì)胞系鑒定的基本要求外,《Journal of Hepatology》還聲明它將不再考慮使用一些已知被錯誤鑒別的細(xì)胞系(BEL7402、SMMC7721、MHCC97L等等)。美國國立衛(wèi)生研究院是將細(xì)胞系鑒定作為資助條件的資助機構(gòu)之一。
短串聯(lián)重復(fù)序列(shorttandem repeat)(STR)分析法是期刊接受的人類細(xì)胞系鑒定方法,這是一種用于法醫(yī)學(xué)的DNA指紋技術(shù)。它是一種基于PCR的技術(shù),該方法同時測試大量多態(tài)微衛(wèi)星位點。STR分析可以將細(xì)胞系匹配到供體(如果供體的STR圖譜是已知的話)或已知STR圖譜的細(xì)胞系。然而,如果特意從同一供體上建立了兩種以上細(xì)胞系,那么這兩種細(xì)胞系不能通過STR分析來區(qū)分。由于細(xì)胞傳代的遺傳漂變,所培養(yǎng)的細(xì)胞的STR圖譜可能不會與供體100%匹配。目前的標(biāo)準(zhǔn)是用≥80%的匹配來確認(rèn)細(xì)胞系的身份[5]。
有關(guān)這一問題以及使用細(xì)胞系的推薦做法的更多信息,請查看細(xì)胞系認(rèn)證委員會(ICLAC)的網(wǎng)站。ICLAC提供當(dāng)前已知被錯誤鑒別的細(xì)胞系的索引,該索引現(xiàn)在列有488種細(xì)胞系。你還可以找到人類細(xì)胞系STR圖譜數(shù)據(jù)庫的鏈接以及關(guān)于此問題的許多其它的出版物和網(wǎng)址。
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